GeneCodeのパーツでは特定の属性値を削除する処理が含まれています。
例えば、TABLEFORM03パーツではパーツのHTMLの中で以下のように削除する属性値を列挙しています。

<var value="align, alink, axis, background,  bgcolor, border,
 cellpadding, cellspacing, char, charoff, clear, color,
 cols, compact, coords, face, frame, frameborder, height, hspace, link,
 marginheight, noshade, rows, size, text, valign, vlink, vspace, width" gcp="item:start.removeAttrs">

PCサイトのcolor属性をそのまま出力したい場合は、上記からcolorを削除してください。
パーツのHTMLは、IDEの「パーツ設定パネル→Viewを編集する」機能から編集が可能です。