GeneCodeによるコンテンツ変換後もEUC-JPで出力されるため、metaタグでのcharset指定はEUC-JPとして頂く必要がございます。
IDEに含まれているパターンファイル（genecode\projects\project1\pattern\default01.htmlなど）はmetaタグでのcharset指定がUTF-8となっておりますので、ご注意ください。
Shift-JISなどUTF-8以外のキャラクタエンコーディングでPCサイトを制作されている場合は、同様に注意が必要です。

テンプレートファイル自体のキャラクタエンコーディングはUTF-8で作成していただく必要があります。IDEで開発する場合は、特に意識する必要はございません。